Выстраиваемая система работы с резидентами института предусматривает различные направления формирования замысла исследования и его реализации: прямой запрос на исследования – резиденты выполняют исследования по инициативе института; обратные запросы – резиденты заранее представляют свои проекты исследований, из которых отбираются лучшие и их реализация получает поддержку института; совместные исследования – организация и выполнение совместных проектов, в том числе с международным участием (гранты, целевые программы, объединенные лаборатории и т.п.).